猕猴桃腐烂病称葡萄座腔菌，属子囊菌亚门，葡萄座腔菌属真菌。子座生于皮层下，不规则形，内生1至数个子囊腔，扁圆形或洋梨形，黑褐色，有乳头状孔口，子囊长棍棒状，无色，子囊孢子无色，单胞，椭圆形，双列。无性阶段为分生孢子器散，扁圆形，分生孢子无色，单胞，长椭圆形。
