A、若仅考虑一对等位基因，种群中有6种不同的交配类型，A错误；B、鉴别和保留纯种抗锈病（显性）小麦的方法有自交法和测交法，其自交法是最简易的方法，B正确；C、通过测交可以推测被测个体的基因型和产生配子的种类，但不能推测被测个体产生配子的数量，C错误；D、F1产生配子的种类及比例最能说明基因分离定律的实质，D错误．故选：B．
