办合作社、协会是不需要办理动物防疫条件合格证的。《动物防疫法》规定:兴办动物饲养场(养殖小区)和隔离场所,动物屠宰加工场所,以及动物和动物产品无害化处理场所,应当办理动物防疫条件合格证。经营动物、动物产品的集贸市场应当具备国务院兽医主管部门规定的动物防疫条件,并接受动物卫生监督机构的监督检查。你也可以查阅一下《动物防疫条件审查办法》,看看都有什么需要办证,达到什么样的条件可以取得合格证。