不知道你所说的“三方协议”是哪三方？这个国企是否是你的工作单位？如果是你的单位，“三方协议”在加盖公章后成立并生效，该协议所约定的内容对你以及单位都具有约束力，否则将构成违约。但是，根据《劳动合同法》规定，一般应当是对协议中有关“商业秘密、知识产权、竞业限制”内容约定违约金，如果你是一般员工，不涉及这些内容，不需要约定违约金。协议从你公司盖章后寄回，又附加所谓学位证内容的“一张纸”因没有事先与你协商确定，故而对你不产生约束力。此外，如果“三方协议”中的违约金是事先打印好的，说明这不是你们在平等自愿的基础上形成的，是你们公司的规定而不是你们之间的约定，那么，你解除这份协议是不需承担违约金。
任何签订的条文必须是三方共同协商完成，不能单方面进行修改。所以这张纸无效
既然是协议 那就应平等协商 他擅自加上去的条款 自然就没有效力了
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