解:A、近似数25.0精确到十分位,25的精确到个位,所以A选项错误;B、近似数0.003020的有效数字为3、0、2、0,所以B选项正确;C、近似数2.50精确到百分位,25的精确到个位,所以C选项错误;D、0.3998精确到百分位是0.40,所以D选项错误.故选B.